I prudutti

Avemu recentemente infurmatu chì u nucleotide di pirene hè inseritu preferibilmente in fronte à un situ abasicu, u 3'-T di un dimeru di timina, è a maiò parte di e basi intacte da a DNA polimerasi di lievito eta (pol eta).Perchè u pirene hè una molécula non polare senza capacità di legame H, l'efficienze inusualmente elevate di l'inserzione di dPMP sò attribuite à a so capacità di stacking di basa superiore, è sottolineanu l'impurtanza di stacking di basa in a selezzione di nucleotidi da pol eta.Per investigà u rolu di l'H-bonding è a geometria di coppie di basi in a selezzione di nucleotidi per pol eta, avemu determinatu l'efficienze di inserimentu di i nucleotidi mudificati di basa 2,6-diaminopurine, 2-aminopurine, 6-chloropurine, è inosina chì avissiru. fà un nùmeru sfarente di ligami H cù a basa di u mudellu secondu a geometria di a coppia di basa.L'accoppiamentu di basi Watson-Crick pare avè un rolu impurtante in a selezzione di l'analogi di nucleotidi per l'inserimentu oppostu à C è T, cum'è pruvucatu da a diminuzione di l'efficienze d'inserzione relative cù una diminuzione di u numeru di ligami H Watson-Crick è un aumentu di u numeru di interazzione donatore-donatore è accettatore-accettore.A selettività di l'inserimentu di nucleotidi hè più grande oppostu à u 5'-T cà u 3'-T di u dimeru di timina, in accordu cù u travagliu precedente chì suggerenu chì u 5'-T hè tenutu più rigidamente cà u 3'-T.Inoltre, l'inserimentu di A oppostu à i dui Ts di u dimeru pare esse mediatu da l'accoppiamentu di basi Watson-Crick è micca da l'accoppiamentu di basi Hoogsteen basatu annantu à l'efficienze d'inserzione quasi identiche di A è 7-deaza-A, l'ultima di quale manca H- capacità di ligame à N7.L'efficienze relative per l'inserimentu di nucleotidi chì ponu formate coppie di basi Watson-Crick parallele à quelli per u frammentu di Klenow, mentri u frammentu di Klenow discrimina più forte contra i disaccordi, in accordu cù a so selettività di forma più grande.Questi risultati sottolineanu l'impurtanza di l'H-bonding è di a geometria di a coppia di basi Watson-Crick in a selezzione di nucleotidi sia da pol eta sia da u frammentu di Klen ow, è u rolu minore di a selezzione di forma in l'inserzione da pol eta per via di a so più aperta è menu. situ attivu custrettu.